Yo diría que la idea detrás del plot chart es que los puntos se han obtenido a partir de pares (x,y) de valores (también podrían ser ternas, o incluso 4 valores en física relativista). No tienen por qué unirse con líneas, o curvas, pero podría hacerse (pese a llamarse gráfico de puntos), porque esto nunca va a afectar al significado del gráfico.
Un gráfico de barras suele usarse más bien en en economía, ciencias sociales, etc., mientras que el de puntos se más común en ciencia, ya que los valores son más concretos, más "puntuales".
Espero no haber liado mucho la cosa.